wisegeneusa K003说明书

 

wisegeneusa K003说明书

wisegeneusa的使命是开发,制造和提供新型基因组测序和检测技术的研究工具。我们将继续许可,开发和商业化表观遗传学中的新基因组测序试剂和方法。

 

5-羟甲基胞嘧啶是一种DNA甲基化修饰,由铁依赖性脱氧酶的Tet家族酶促氧化5-甲基胞嘧啶(5-mC)而发生

 

关于我们的TAB-seq套件,请注意以下事项。

TAB-seqβGT保护效率说明

关于我们的TAB-seq套件,请注意以下事项:

 

1.我们提供的5hmC加标对照通过使用5-羟甲基胞嘧啶dNTP混合物的PCR扩增产生。原则上,5hmC加标对照中的所有胞嘧啶应该是100%羟甲基化的。然而,由于商业化5hmdCTP的杂质和暴露于空气中5hmC的缓慢氧化,5hmC加标对照中每个胞嘧啶位点的实际5hmC丰度约为80%。结果,即使在标准亚硫酸氢盐测序中,5hmC加标对照中仅80%的胞嘧啶将被读作'C'。该数量(~80%)可能会根据5hmC加标控制的存储条件/时间而变化。

 

为了准确评估TAB-seq中5hmC的保护率,我们建议对含有相同批次的5hmC加标对照的一个样品进行标准亚硫酸氢盐测序,以确定其真正的5hmC丰度。例如,如果5hmC加标对照中80%的胞嘧啶在标准亚硫酸氢盐测序中读作'C',其中70%在TAB-seq中读作'C',则表明您的TAB-的实际保护率seq测定应为0.7 / 0.8 = 87.5%但不是70%。

 

2.在βGT保护后,当使用某种聚合酶(例如Taq聚合酶)时,5hmC对照上的浓密5gmC可能停止聚合。为了避免可能的PCR偏差,建议将PfuTurbo Cx hotstart聚合酶(Agilent)或等同物用于文库构建中的终PCR扩增步骤。

 

5mC Tet1氧化试剂盒

5mC Tet1 Oxidation 

目录号:K003

单价:每件套669美元

 

 

产品说明

5mC Tet1氧化试剂盒可用于将基因组DNA中的5-甲基胞嘧啶(5mC)转化为5-羧基胞嘧啶(5caC)用于随后的测序应用。

每个试剂盒包含足够的试剂,可根据推荐的方案进行多达3个全基因组或9个基因座特异性测序反应。

 

存储

在抵达时在-80℃储存5mC Tet1氧化试剂盒。Tet1蛋白对温度敏感; 应避免多次冻融。

5hmC TAB-Seq Kit

Catalog No: K001

Unit Price: $969 / per kit

5hmC/5mC TAB-Array Kit (compatible to Infinium 450K Array)

Catalog No: K002

Unit Price: $869 / per kit

5mC Tet1 Oxidation Kit for the PacBio® RS Instrument

Catalog No: K004

Unit Price: $669 / per kit

5hmC DNA Standard

Catalog No: S002

Unit Price: $30 each

5mC DNA Standard

Catalog No: S001

Unit Price: $30 each

 

 

 

 

 

 

上海金畔生物科技有限公司是实验试剂一站式采购服务商

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