自动化高通量的单细胞全长转录组分析(SMART-Seq Pro)酶试剂盒Takara


自动化高通量的单细胞全长转录组分析(SMART-Seq Pro)
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  自动化高通量的单细胞全长转录组分析(SMART-Seq Pro)
 
SMART-Seq技术助力ICELL8 cx系统单细胞全长转录组分析方案
 
全长序列覆盖可以实现对整个转录的差异表达分析,并且可以对基因融合、剪接体这类生物标志物进行检测。高灵敏度的SMART-Seq Pro可以胜任以上分析需求。
SMART-Seq Pro Application Kit将SMART-Seq试剂与ICELL8 cx Single-Cell System(Cat No. 640188)相结合,并整合了生物信息学工具,提供一套端到端的单细胞全长转录组分析流程,一次实验可以对1,200~1,500个分离的单细胞进行高效的全长转录组分析。
通过ICELL8 cx系统将细胞分注到ICELL8 350v Chip(Cat No. 640019)空白微孔芯片中。使用ICELL8 cx CellSelect Software鉴定出含单个细胞的微孔,文库构建试剂只被分注到这些选中的微孔中。经过一系列分注和扩增步骤后,获得无偏倚的全长cDNA,并通过Illumina Bead-Linked Transposome(BLT)完成酶切片段化。在这一扩展性的工作流程中,cDNA扩增阶段引入了Illumina特异性接头序列,生成的文库已连接index接头,可直接用于Illumina测序平台。测序过程结束后,获得的测序数据可直接导入Cogent NGS软件工具进行生物信息学分析,解释测序结果。
 
NOTE:旧版本SMART-Seq Application Kit(Cat No. 640222)依然可以购买。
 
更多孔板测序应用,请参见 单细胞RNA-Seq / DNA-Seq
 
■ 概述
· 端到端的解决方案:从文库制备到测序数据分析工具
· 覆盖全长mRNA:捕获转录组中“深藏”的关键生物标志物,如基因融合、剪接异构体
· 高通量单细胞分析:可以平行地从>1,000个单细胞中生成测序数据
· 样品配置灵活:一次实验最多可对八种细胞样品进行分析
· 减少样品操作:减小数据波动,构建测序文库前自动鉴定并分选出感兴趣的细胞,仅对这些细胞进行试剂分注
· Illumina平台测序文库:制备的测序文库适用于Illumina全系平台
 
■应用
用于Illumina平台上高通量全长单细胞转录组测序文库制备
自动化高通量的单细胞全长转录组分析(SMART-Seq Pro)
图1. SMART-Seq Pro和Smart-seq2在PBMCs中基因检测结果比较
 
 
Technote:
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自动化高通量的单细胞全长转录组分析(SMART-Seq Pro)
 
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